Zasada ta nie będzie miała zastosowania:
- do osób zatrudnionych przy pilnowaniu oraz
- gdy, na wniosek osoby zatrudnionej, lekarz przeprowadzający badania profilaktyczne pracowników lub w razie jego braku lekarz sprawujący opiekę nad tą osobą wyrazi na to zgodę.
Częstym błędem popełnianym przez pracodawców jest kierowanie pracowników z orzeczonym stopniem niepełnosprawności na badania lekarskie w celu ustalenia dopuszczalności stosowania odstępstwa od obowiązujących ich norm czasu pracy. Przepis wprost przerzuca w tym przypadku inicjatywę na stronę pracownika. To on może wystąpić z wnioskiem do pracodawcy o skierowanie na badania w celu ustalenia, czy może pracować w innym wymiarze godzin pracy niż wynikający z ustawy. Zatem z treści art. 16 ustawy z dnia 27 sierpnia 1997 r. o rehabilitacji zawodowej i społecznej oraz zatrudnianiu osób niepełnosprawnych wynika, że pracodawca nie może skierować pracownika na przedmiotowe badania lekarskie z własnej woli.
Kolejną kwestią wymagającą wyjaśnienia jest zagadnienie rodzaju i zakresu odstępstwa od ogólnych zasad. Lekarz sprawujący profilaktyczną opiekę zdrowotną nad pracownikami lub w razie jego braku lekarz sprawujący opiekę nad osobą niepełnosprawną może zezwolić na pracę tej osoby tylko w godzinach nadliczbowych lub w porze nocnej lub w ogóle wyłączyć stosowanie art. 15 wskazanej wyżej ustawy w stosunku do określonej osoby z orzeczonym stopniem niepełnosprawności. To ostatnie rozwiązanie wydaje się najbardziej korzystne dla pracodawców. Daje ono możliwość świadczenia pracy przez pracownika zatrudnionego na innym stanowisku niż przy pilnowaniu nie tylko w godzinach nadliczbowych lub w porze nocnej, ale również w równoważnym systemie czasu pracy lub w zmianowej organizacji pracy.