W art. 41 ust. 1 ustawy o podatku dochodowym od osób fizycznych wskazano, że w celu obliczenia zaliczki na podatek od umowy zlecenia lub umowy o dzieło płatnik powinien przychód pomniejszyć m.in. o miesięczne koszty uzyskania przychodów w wysokości określonej w art. 22 ust. 9 ustawy o podatku dochodowym od osób fizycznych. W świetle przywołanego przepisu koszty przy umowie zlecenie i umowie o dzieło wynoszą 20%. Natomiast w przypadku, gdy czynność stanowi przedmiot prawa autorskiego, koszty uzyskania przychodu wynoszą 50%.
Jak wynika z art. 22 ust. 10 wspomnianej ustawy, przy ustalaniu dochodu z powyższych tytułów ustawodawca przewidział również możliwość zastosowania kosztów uzyskania przychodów w wysokości wydatków faktycznie poniesionych. Warto jednak zauważyć, iż powołane powyżej brzmienie art. 41 ust. 1 ustawy o podatku dochodowym od osób fizycznych wyklucza możliwość zastosowania faktycznie poniesionych wydatków na etapie obliczania zaliczki na podatek przez płatnika. Prawo zaliczenia do kosztów uzyskania przychodów wydatków faktycznie poniesionych przez podatnika przysługuje dopiero w chwili składania zeznania o wysokości uzyskanego dochodu lub poniesionej straty za dany rok podatkowy. Na podatniku ciąży również w tej sytuacji obowiązek prawidłowego udokumentowania wydatków pomniejszających przychód podlegający opodatkowaniu.